RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1RL1Q01638 556 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIGFQ07326 219 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADRM1Q16186 407 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC36A3Q495N2 470 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC26Q8NHZ8 85 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGREF1Q99674 301 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.11■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALPK3Q96L96 1907 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALBP02768 609 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP17A1P05093 508 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKACGP22612 351 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPAP23025 273 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH3B2P48448 385 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPINT3P49223 89 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMBIM1Q969X1 311 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISOC1Q96CN7 298 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF382Q96SR6 550 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXorf21Q9HAI6 301 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100A1P23297 94 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYF6P23409 242 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCYT1AP49585 367 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK9P50750 372 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C21orf59P57076 290 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD8Q6ZWB6 473 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THAP11Q96EK4 314 aa15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR23AA6NEV1 266 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAD51BO15315 384 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOCS5O75159 536 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TULP3O75386 442 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPGP40121 348 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTHFRP42898 656 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPIAP49247 311 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF3Q13114 568 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAPTM4AQ15012 233 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOX1Q15067 660 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D21Q8IYX1 336 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STK40Q8N2I9 435 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIX1Q8N485 282 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELMO1Q92556 727 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PPW3 197 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM1AO60341 852 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFCAB14O75071 495 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL7RP16871 459 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS4P49798 205 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMX2Q04743 252 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPP7Q5T2T1 576 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPTCQ9UBM4 332 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PADI4Q9UM07 663 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE10AQ9Y233 779 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRELID1Q9Y255 219 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATE1O95260 518 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMP2P16035 220 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGKGP49619 791 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNB3Q05901 458 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HM13Q8TCT9 377 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BDH2Q9BUT1 245 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPY30Q9C005 99 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EHD1Q9H4M9 534 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZIM2Q9NZV7 527 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.09■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLK8O60259 260 aa15.08■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DGKAP23743 735 aa15.08■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDHA2P29803 388 aa15.08■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB39AQ14964 217 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms