RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC31Q6UY01 552 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINGO4Q6UY18 593 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RRM2BQ7LG56 351 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM139Q8IV31 216 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FRMD1Q8N878 549 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FIBINQ8TAL6 211 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCSTNQ92542 709 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIP5K1AQ99755 562 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNX15Q9NRS6 342 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PQF6 199 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTC34A8MYJ7 566 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7ERQ8 282 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CES2O00748 559 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRPSAP2O60256 369 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF8O76064 485 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NXPH3O95157 252 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFA10O95299 355 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLATP00750 562 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUBB4AP04350 444 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD48P09326 243 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4B1P13584 511 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOT1P17174 413 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRPH2P23942 346 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHB2P29323 1055 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR1E1P30953 314 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNR2P34972 360 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGEA9P43362 315 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH4P55283 916 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC16Q13042 620 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf22Q49AR2 442 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MPP7Q5T2T1 576 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RLN3Q8WXF3 142 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NTAN1Q96AB6 310 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLHL29Q96CT2 875 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALG14Q96F25 216 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PERPQ96FX8 193 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf74Q96LT6 269 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMB7Q99436 277 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H7C0S8 307 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BUB1O43683 1085 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG13O75143 517 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLDN11O75508 207 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROSCO94903 275 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APBB3O95704 486 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APOA4P06727 396 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPI1P60174 286 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NHLH1Q02575 133 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPA17Q15506 151 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EOGTQ5NDL2 527 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VWA1Q6PCB0 445 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GALNT7Q86SF2 657 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP14Q86W24 1093 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB119Q8N690 84 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLC2Q9H0B6 622 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLC4Q9NSK0 619 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms