RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF2H4Q92759 462 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 EME1Q96AY2 570 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PYCR2Q96C36 320 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 HHIPQ96QV1 700 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF4O60810 478 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ERN1O75460 977 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 KAT7O95251 611 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PREPP48147 710 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 C21orf58P58505 322 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PKP4Q99569 1192 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 CD320Q9NPF0 282 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 MMP20O60882 483 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf105O95561 183 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 AMD1P17707 334 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMC3P17980 439 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 IMPA1P29218 277 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 P2RY2P41231 377 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 DGKQP52824 942 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 AGERQ15109 404 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 COX14Q96I36 57 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 RMND5AQ9H871 391 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 ITM2CQ9NQX7 267 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 GULP1Q9UBP9 304 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 NCOR1O75376 2440 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP2-202ENST00000435136 APODP05090 189 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TEAD1P28347 426 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 RPA4Q13156 261 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 GRM2Q14416 872 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TBCELQ5QJ74 424 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 UNC5DQ6UXZ4 953 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPV3Q8NET8 790 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2L2Q8NH16 312 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 STARD8Q92502 1023 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR34Q96EX3 536 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 HIC2Q96JB3 615 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF597Q96LX8 424 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 OR2AG1Q9H205 316 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNH6Q9H252 994 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 EPHX1P07099 455 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 NAE1Q13564 534 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 XKR6Q5GH73 641 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 SPANXN4Q5MJ08 99 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM74Q96NL1 305 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A096LPI6 279 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL33A6NCF5 533 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 FASP25445 335 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 BDKRB1P46663 353 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 PDK3Q15120 406 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D21Q8IYX1 336 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 REPS1Q96D71 796 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 EHD1Q9H4M9 534 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 ANAPC2Q9UJX6 822 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 HCN2Q9UL51 889 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNE2Q9Y6J6 123 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIOO75962 3097 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 MGAT4DA6NG13 374 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 K7ESM1 405 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC16A8O95907 504 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 ADH1BP00325 375 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 SDC1P18827 310 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP2-202ENST00000435136 S100A3P33764 101 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms