RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 UBE2J2Q8N2K1 259 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ARL15Q9NXU5 204 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 USE1Q9NZ43 259 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RFXANKO14593 260 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MBTPS1Q14703 1052 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CYP27C1Q4G0S4 372 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RNF38Q9H0F5 515 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SERHLQ9NQF3 203 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 IL37Q9NZH6 218 aa16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC28A1O00337 649 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CLDN11O75508 207 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 COL6A1P12109 1028 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ALOX12P18054 663 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ITPKAP23677 461 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MAGEA11P43364 429 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 VLDLRP98155 873 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 HORMAD1Q86X24 394 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 PLD3Q8IV08 490 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CHPFQ8IZ52 775 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 APIPQ96GX9 242 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RDH12Q96NR8 316 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SH3GL1Q99961 368 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MROQ9BYG7 248 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 C2orf78A6NCI8 922 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CHRNA6Q15825 494 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 HIPK1Q86Z02 1210 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZBTB2Q8N680 514 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 IL26Q9NPH9 171 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GLTPD2A6NH11 291 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TBL1XO60907 577 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 STK16O75716 305 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CA8P35219 290 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MVKQ03426 396 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SELENBP1Q13228 472 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 DGUOKQ16854 277 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GPR153Q6NV75 609 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 STC2O76061 302 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GABARAPO95166 117 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 VIPP01282 170 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GJA8P48165 433 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 KCNC4Q03721 635 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC103Q8IW40 242 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 STK40Q8N2I9 435 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SCN3BQ9NY72 215 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 OARD1Q9Y530 152 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 VWA8A3KMH1 1905 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ILVBLA1L0T0 632 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CD36P16671 472 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 DGKAP23743 735 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 NFATC2Q13469 925 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MFSD4AQ8N468 514 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 OR2T29Q8NH02 315 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MYO19Q96H55 970 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 NINQ8N4C6 2090 aa16.73■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 MFN2O95140 757 aa16.72■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 NTRK1P04629 796 aa16.72■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 RETP07949 1114 aa16.72■□□□□ 0.27
SEPHS1-201ENST00000327347 KRT20P35900 424 aa16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms