RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KLQ9UEF7 1012 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 POLG2Q9UHN1 485 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CA14Q9ULX7 337 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KANSL1LA0AUZ9 987 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM170BA6NMN3 283 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MANBAO00462 879 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFRSF10CO14798 259 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF9O75901 435 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC16A8O95907 504 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-19P01714 112 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC35G4P0C7Q5 338 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IL9P15248 144 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GNAZP19086 355 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ITPKAP23677 461 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ADH6P28332 368 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HNF4AP41235 474 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HALP42357 657 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GNPDA1P46926 289 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR5P51681 352 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 STARD6P59095 220 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1024LP59773 190 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PFN3P60673 137 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2CBP62714 309 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVK-8P63133 956 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP2CAP67775 309 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 EMX2Q04743 252 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDH1Q08174 1060 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CHIT1Q13231 466 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 UBXN2BQ14CS0 331 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IMPG1Q17R60 797 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MMEL1Q495T6 779 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 AGKQ53H12 422 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PYCR3Q53H96 274 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 XKR7Q5GH72 579 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf89Q6UX73 402 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZSR9 355 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX32Q86XE0 403 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 OR56A3Q8NH54 315 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPEARQ8WU66 669 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MED8Q96G25 268 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GUCD1Q96NT3 240 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC23A2Q9UGH3 650 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 EBF1Q9UH73 591 aa9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FFAR3O14843 346 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 AIM2O14862 343 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR42O15529 346 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM1AO60341 852 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ACP5P13686 325 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A4P14672 509 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 JUPP14923 745 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IMPA1P29218 277 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFALSP35858 605 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 BDKRB1P46663 353 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCNKAP51800 687 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 THOP1P52888 689 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CUL3Q13618 768 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GRB7Q14451 532 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT33BQ14525 404 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SGO1Q5FBB7 561 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 XKR6Q5GH73 641 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FRG2Q64ET8 278 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 LPCAT2Q7L5N7 544 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF480Q8WV37 535 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MARK4Q96L34 752 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR92Q96MX6 357 aa9.8□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FRG2BQ96QU4 278 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms