RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SCYL1Q96KG9 808 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 GPR78Q96P69 363 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CD274Q9NZQ7 290 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TAC3Q9UHF0 121 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PMS2P1A4D2B8 440 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT3HB4E1H0 165 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KERAO60938 352 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT3HO75486 399 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 S100BP04271 92 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 JMJD7P0C870 316 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF844Q08AG5 666 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK2BQ13554 666 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KRT71Q3SY84 523 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CLEC14AQ86T13 490 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 IQCKQ8N0W5 287 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RHEBL1Q8TAI7 183 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB9Q96C00 473 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PYCR2Q96C36 320 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZIM3Q96PE6 472 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ATOH8Q96SQ7 321 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 OCIAD1Q9NX40 245 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB7A8K855 629 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PLD2O14939 933 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CCL4P13236 92 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ITIH1P19827 911 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 HNMTP50135 292 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 GABREP78334 506 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 HSD11B2P80365 405 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KMT5CQ86Y97 462 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 OR2L3Q8NG85 312 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RHBDF1Q96CC6 855 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM109Q9BVC6 243 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PISDQ9UG56 409 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SPTBP11277 2137 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SYCE1LA8MT33 242 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 UBXN8O00124 270 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MAP3K7O43318 606 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MAGP20916 626 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CCND1P24385 295 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CMPK1P30085 196 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 YBX1P67809 324 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KCNAB1Q14722 419 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TECRLQ5HYJ1 363 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 WWOXQ9NZC7 414 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF10O60809 474 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 RBP1P09455 135 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MAPK10P53779 464 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SH3BP2P78314 561 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SHC2P98077 582 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FOXM1Q08050 763 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PTCHD3Q3KNS1 767 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO48Q5FWF7 155 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ICE2Q659A1 982 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 OR56A3Q8NH54 315 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 NRSN2Q9GZP1 204 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PDE7BQ9NP56 450 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 XPR1Q9UBH6 696 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 AK5Q9Y6K8 562 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC189A1A4V9 331 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 CCNDBP1O95273 360 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 FKBP9O95302 570 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 EBLN1P0CF75 366 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 KRT4P19013 534 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 ETV5P41161 510 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 TCAIMQ8N3R3 496 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 D2HGDHQ8N465 521 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 PDPRQ8NCN5 879 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXD4-201ENST00000306324 SGPP1Q9BX95 441 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms