RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WASH6PQ9NQA3 447 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF225Q9UK10 706 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC22A14Q9Y267 594 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 R4GN57 208 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSC2O15499 205 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STK16O75716 305 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 WDR47O94967 919 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNSP15586 552 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EPORP19235 508 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HALP42357 657 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CTSKP43235 329 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF2H2Q13888 395 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TEAD4Q15561 434 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NAGSQ8N159 534 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RAD51AP1Q96B01 352 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMK1GQ96NX5 476 aa23.12■■□□□ 1.29
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OPTCQ9UBM4 332 aa23.12■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR7A17O14581 309 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CNR2P34972 360 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNMTP50135 292 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT33BQ14525 404 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC6Q16204 474 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBBP7Q16576 425 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IYDQ6PHW0 289 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYT12Q8IV01 421 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYTL1Q8IYJ3 562 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM46DQ8NEK8 389 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KCNA7Q96RP8 456 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.11■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 K7EPI3 171 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESRRBO95718 433 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOXA1P55317 472 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BNIP3Q12983 259 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM198Q66K66 360 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC23LQ6PF05 361 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHSY3Q70JA7 882 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SYVN1Q86TM6 617 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C19orf60Q96EN9 201 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CATSPER2Q96P56 530 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4K3Q96R72 315 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1orf21Q9H246 121 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRGBPQ9NV56 204 aa23.1■■□□□ 1.29
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHBQ15464 509 aa23.1■■□□□ 1.29
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR52E1Q8NGJ3 308 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF382Q96SR6 550 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC32A1Q9H598 525 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IPPKQ9H8X2 491 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa23.1■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 E7ENX8 843 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GIPC1O14908 333 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YY2O15391 372 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CRCPO75575 148 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIAS2O75928 621 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPN2P04844 631 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CFIP05156 583 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COX4I1P13073 169 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PIK3R1P27986 724 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PNLIPRP1P54315 467 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TBPL1P62380 186 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TAP2Q03519 686 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDC16Q13042 620 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DEFB133Q30KQ1 61 aa23.09■■□□□ 1.29
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNX31Q8N9S9 440 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR56A3Q8NH54 315 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC37A2Q8TED4 501 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CXorf40BQ96DE9 158 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.09■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CACNA1EQ15878 2313 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AQP9O43315 295 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRAMEF4O60810 478 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KATNA1O75449 491 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATP6V1G2O95670 118 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 YBX1P67809 324 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ELOCQ15369 112 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa23.08■■□□□ 1.29
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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