RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 PCCBP05166 539 aa14.86□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 CDK3Q00526 305 aa14.86□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 NEK2P51955 445 aa14.84□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 NFE2L1Q14494 772 aa14.84□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 CNBD2Q96M20 576 aa14.84□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.84□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 E7EQ34 232 aa14.83□□□□□ -0.03
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SF3B4-201ENST00000271628 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SF3B4-201ENST00000271628 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
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