RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 A8MUA0 341 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TEX28O15482 410 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 PI15O43692 258 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 NME6O75414 186 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 STC2O76061 302 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GADD45GO95257 159 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 S1PR4O95977 384 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 PRPS2P11908 318 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HNF1BP35680 557 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ASMTP46597 345 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RHDQ02161 417 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GNA13Q14344 377 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LRRC32Q14392 662 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 AMZ1Q400G9 498 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 DCST1Q5T197 706 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 KLHL35Q6PF15 583 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TRPV3Q8NET8 790 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 BIRC7Q96CA5 298 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TMEM248Q9NWD8 314 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ENOPH1Q9UHY7 261 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GJD2Q9UKL4 321 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 FZD4Q9ULV1 537 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RAB26Q9ULW5 256 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TMCO1Q9UM00 188 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.39□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PP18 115 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPW3 197 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ZNF840PA6NDX5 716 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 H7BY64 318 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LEFTY2O00292 366 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ADAM12O43184 909 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TBX1O43435 398 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 XPNPEP2O43895 674 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ZNF623O75123 536 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LEFTY1O75610 366 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H2ABP04908 130 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 T-ENOLP0DO92 83 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RAP2AP10114 183 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 KCNA5P22460 613 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 CAPGP40121 348 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 VIPR2P41587 438 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R50P59544 299 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SH3BP2P78314 561 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GPM6BQ13491 265 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 MEP1AQ16819 746 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 GPR33Q49SQ1 333 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 UNC50Q53HI1 259 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TIFABQ6ZNK6 161 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TMEM25Q86YD3 366 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HPS1Q92902 700 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H2ACQ93077 130 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 IKZF2Q9UKS7 526 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SSR3Q9UNL2 185 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 NUP98P52948 1817 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 C5P01031 1676 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SLC35F4A4IF30 521 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 CENPXA8MT69 81 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SNPHO15079 494 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TSPAN6O43657 245 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 AIREO43918 545 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SCELO95171 688 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 MATN4O95460 622 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 SNAP29O95721 258 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 TYRP1P17643 537 aa5.38□□□□□ -1.55
LMO3-201ENST00000261169 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms