RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Swi5Q8K3D3 89 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NotumQ8R116 503 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufs2Q91WD5 463 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a46Q9CQS4 418 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tspan11Q9D1D1 253 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glod5Q9D8I3 148 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nipa2Q9JJC8 359 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HgfacQ9R098 653 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb18Q9WUK6 522 aa9.71□□□□□ -0.85
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ZxdbA2CE44 873 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6569D3YTM9 175 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 WapP01173 134 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifngr1P15261 477 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TP20293 436 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccr7P47774 378 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sult2a2P50236 285 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q3KNL4 93 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CcnjQ3TZI6 379 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc26a10Q5EBI0 492 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh24Q6PFX6 781 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim36Q80WG7 729 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Katnb1Q8BG40 658 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St3gal4Q91Y74 333 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chil4Q91Z98 402 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syt12Q920N7 421 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnk1Q99ML2 666 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhj1Q9D240 164 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aph1cQ9DCZ9 258 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chrm3Q9ERZ3 589 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt6bQ9Z331 562 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scgb2b17S4R2V3 82 aa9.71□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnpepl1G5E872 720 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r95L7N274 845 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r8L7N472 848 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scamp3O35609 349 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gh1P06880 216 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdh6P97326 790 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nup62Q63850 526 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lamp3Q7TST5 411 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc24Q8BYG0 334 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dppa4Q8CCG4 296 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Crlf2Q8CII9 359 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 N4bp2l2Q8JZS6 575 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Traf7Q922B6 594 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Col25a1Q99MQ5 666 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Natd1Q9DBW3 110 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ern1Q9EQY0 977 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp985A2A7A5 519 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem201A2A8U2 664 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lzts3A2AHG0 700 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dlgap4B1AZP2 992 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21293E9Q4G9 266 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xkr6E9Q6C8 638 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r67K7N6T2 851 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NsmafO35242 920 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FiglaO55208 194 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccr5P51682 354 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AbatP61922 500 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prelid2Q0VBB0 177 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CrhbpQ60571 322 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Brinp2Q6DFY8 783 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RragdQ7TT45 449 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hyal5Q812F3 526 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Samd3Q8C4H2 520 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam126bQ8C729 530 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr729Q8VET4 323 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Setd7Q8VHL1 366 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smim14Q91VT8 99 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcl7bQ921K9 202 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Timm22Q9CQ85 194 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc81Q9D5W4 654 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sacm1lQ9EP69 587 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp4a12bA2A974 508 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Skint2A7XUX6 400 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SprtnG3X912 497 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Npc1O35604 1277 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ChadO55226 358 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chst3O88199 472 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rdh7O88451 316 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prf1P10820 554 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nat3P50296 290 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcadvlP50544 656 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2c38P56655 490 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap2s1P62743 142 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 StamP70297 548 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfsd2bQ3T9M1 494 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ggt1Q60928 568 aa9.7□□□□□ -0.86
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim45Q6PFY8 580 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms