RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612086.1

5S_rRNA.23-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 102 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CLGNO14967 610 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SLC16A5O15375 505 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KERAO60938 352 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GLRA3O75311 464 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RFPL1O75677 317 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TCEA3O75764 348 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 WDR47O94967 919 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KLHL2O95198 593 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ANXA5P08758 320 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 JMJD7P0C870 316 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 THRAP10827 490 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KRT4P19013 534 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ITIH1P19827 911 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MAGP20916 626 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 HSPA7P48741 367 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PDX1P52945 283 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MAPK10P53779 464 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FOXM1Q08050 763 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NAE1Q13564 534 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GRB7Q14451 532 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KCNAB1Q14722 419 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TGFBIQ15582 683 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PPP1R3AQ16821 1122 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ISXQ2M1V0 245 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SPESP1Q6UW49 350 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 WDR48Q8TAF3 677 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SMPDL3AQ92484 453 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PHF21BQ96EK2 531 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CCDC138Q96M89 665 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TMEM74Q96NL1 305 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SMC6Q96SB8 1091 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PISDQ9UG56 409 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FETUBQ9UGM5 382 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 POMT2Q9UKY4 750 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SATB2Q9UPW6 733 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 A0A0J9YY10 115 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SYCE1LA8MT33 242 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MATN2O00339 956 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MAP3K7O43318 606 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 NRP2O60462 931 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PRAMEF10O60809 474 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SMIM24O75264 130 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 STATHP02808 62 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 EBLN1P0CF75 366 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CDK4P11802 303 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CDH1P12830 882 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ST6GAL1P15907 406 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CMPK1P30085 196 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GRIA3P42263 894 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GDF5P43026 501 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MAGEA12P43365 314 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 LSSP48449 732 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AGTR2P50052 363 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 AP1S2P56377 157 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 SH3BP2P78314 561 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 GABREP78334 506 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CYP4F3Q08477 520 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 KIR2DS3Q14952 304 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 PFKFB4Q16877 469 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 HDXQ7Z353 690 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.23-201ENST00000612086 TRABD2AQ86V40 505 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms