RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FIGLAQ6QHK4 219 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 AFTPHQ6ULP2 937 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR11G2Q8NGC1 345 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FAR1Q8WVX9 515 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A18Q96BI1 424 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LHPPQ9H008 270 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EDN3P14138 238 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RBBP7Q16576 425 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF534Q76KX8 674 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00523Q86TU6 105 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 COG1Q8WTW3 980 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF778Q96MU6 729 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS8L2Q9H6S3 715 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ENAMQ9NRM1 1142 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 MAU2Q9Y6X3 613 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPEQ02224 2701 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 MED26O95402 600 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH17Q12864 832 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR1Q15399 786 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SF1Q15637 639 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTE1Q5JU00 501 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TSTD2Q5T7W7 516 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 HEATR9A2RTY3 570 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FITM1A5D6W6 292 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGRF2O14827 1237 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZG16O60844 167 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSVO60911 334 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RPN2P04844 631 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PER3P56645 1201 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC34A3Q8N130 599 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT222Q8N1A0 295 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPER1Q8NEC5 780 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ASZ1Q8WWH4 475 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC1Q99614 292 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 POLEQ07864 2286 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 F8W8V4 182 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL18O94889 574 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PRF1P14222 555 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIA1P42261 906 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ACVR1Q04771 509 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6P1Q8NGX9 317 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4L1Q8NH43 312 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CRB3Q9BUF7 120 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD6Q9BX69 1037 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A10Q9ULF5 831 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP10A1A4S6 786 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT87PA6NCN2 255 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 NRP2O60462 931 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO2B1O94956 709 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 APOA4P06727 396 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 AOAHP28039 575 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMB5P28074 263 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MFAP5Q13361 173 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMPD2BQ6IN97 320 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM180AQ6UWF9 173 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 MARVELD3Q96A59 401 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TSSK1BQ9BXA7 367 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM5Q9C035 493 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ETNK1Q9HBU6 452 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF160Q9HCG1 818 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMKLBQ9ULI2 386 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD12Q6UB98 2062 aa24.5■■□□□ 1.51
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