RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 VPS4AQ9UN37 437 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.9□□□□□ -1.3
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GX78 115 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 F8W8V4 182 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PEX12O00623 359 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP104O60308 925 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPM1O60762 260 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 NIPSNAP2O75323 286 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPC4O75487 556 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEACAM4O75871 244 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 VAPBO95292 243 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPN2P04844 631 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 UMODP07911 640 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGAXP20702 1163 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD9P21926 228 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 AOAHP28039 575 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FMO4P31512 558 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTPAP49638 278 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRB7Q14451 532 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TERF2Q15554 542 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP2A13Q16696 494 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCAF10Q5QP82 559 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX35Q5T0J7 233 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FCRL6Q6DN72 434 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED25Q71SY5 747 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP112Q8N8E3 955 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8NA96 180 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFSD3Q96ES6 412 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 P2RY12Q9H244 342 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TREX1Q9NSU2 369 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CUTCQ9NTM9 273 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 BFARQ9NZS9 450 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSFQ9UBX1 484 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.89□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0J9YVX5 310 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 A1L4Q6 167 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASGRF2O14827 1237 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FFAR3O14843 346 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FANCGO15287 622 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR42O15529 346 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSVO60911 334 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEMA7AO75326 666 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 AVILO75366 819 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 S1PR4O95977 384 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF224P0DH78 156 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGA3P26006 1051 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARNTP27540 789 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1D4P47884 311 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNG2Q16589 344 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRMPD2BQ6IN97 320 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASC4Q6P4E1 433 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC23LQ6PF05 361 aa6.88□□□□□ -1.31
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