RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 RAB43Q86YS6 212 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SLC35F6Q8N357 371 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 BIRC8Q96P09 236 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CCDC68Q9H2F9 335 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 EURLQ9NYK6 297 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NFS1Q9Y697 457 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.67□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CLEC18AA5D8T8 446 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TTLL8A6PVC2 850 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PEX12O00623 359 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KIF5CO60282 957 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CAPN1P07384 714 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MLNP12872 115 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 FOLR3P41439 243 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GABRA4P48169 554 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ARSFP54793 590 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 CTBP1Q13363 440 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GRB7Q14451 532 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 MED25Q71SY5 747 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZBTB2Q8N680 514 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 PTERQ96BW5 349 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MIPEPQ99797 713 aa8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 GALPQ9UBC7 116 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KRT87PA6NCN2 255 aa8.65□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 H3BMH7 237 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PHF2O75151 1096 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 USP1O94782 785 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 MATN4O95460 622 aa8.65□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 MAGEA6P43360 314 aa8.65□□□□□ -1.02
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LMO3-222ENST00000540445 CYP1B1Q16678 543 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 LONRF1Q17RB8 773 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TCTE1Q5JU00 501 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FCRL6Q6DN72 434 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 PPIL6Q8IXY8 311 aa8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
LMO3-222ENST00000540445 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.65□□□□□ -1.02
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