RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		5.06	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898		A0A0G2JNG1	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	LILRA5	A6NI73	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898		F8VZ95	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	F2RL2	O00254	374 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CCP110	O43303	1012 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SOCS5	O75159	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KIAA0754	O94854	1291 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	NDUFA10	O95299	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CBX6	O95503	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PEX11B	O96011	259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	MT-ND3	P03897	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KRT3	P12035	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PRF1	P14222	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	BRAF	P15056	766 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CHRNB2	P17787	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	FPR1	P21462	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	GPD1	P21695	349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	NFKBIA	P25963	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	STT3A	P46977	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PGD	P52209	483 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	GFER	P55789	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	FMO1	Q01740	532 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CDR2	Q01850	454 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	FOXM1	Q08050	763 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	IL10RB	Q08334	325 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SP140	Q13342	867 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	DNASE1L3	Q13609	305 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KIR2DS5	Q14953	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PTPRR	Q15256	657 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	MIIP	Q5JXC2	388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	DENND2C	Q68D51	928 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	WDR59	Q6PJI9	974 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	DOK6	Q6PKX4	331 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	TRIM74	Q86UV6	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF677	Q86XU0	584 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SCRN2	Q96FV2	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PWWP2A	Q96N64	755 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	OR6C1	Q96RD1	312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ING2	Q9H160	280 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ABCG8	Q9H221	673 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	VPS11	Q9H270	941 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ACTL8	Q9H568	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	LHX9	Q9NQ69	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	PADI1	Q9ULC6	663 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.05	□□□□□ -1.6
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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