RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 PAMP19021 973 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CLCN5P51795 746 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MAPK12P53778 367 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 BEX3Q00994 111 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CREMQ03060 361 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 EMC2Q15006 297 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 BCL7AQ4VC05 210 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KIF18BQ86Y91 864 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.64□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.031e-7■■■□□ 16.7
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GPBP1-208ENST00000514387 POM121CA8CG34 1229 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 H3BQ06 376 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GNGT2O14610 69 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 DSCR3O14972 297 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PPM1BO75688 479 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 AHSGP02765 367 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CPN2P22792 545 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 COTL1Q14019 142 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PROX2Q3B8N5 592 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 CES3Q6UWW8 571 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KRT74Q7RTS7 529 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 MIB1Q86YT6 1006 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 LRCH3Q96II8 777 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 C12orf57Q99622 126 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PPA2Q9H2U2 334 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 IL1RL2Q9HB29 575 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SETD4Q9NVD3 440 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 HMGCLP35914 325 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 SPCS3P61009 180 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PIGFQ07326 219 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 Q5BKY6 102 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 JADE1Q6IE81 842 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.63□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 ING3Q9NXR8 418 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 TRAV20A0A0B4J274 112 aa8.62□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 WASH4PA8MWX3 477 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ABCD4O14678 606 aa8.62□□□□□ -1.03
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GPBP1-208ENST00000514387 TSPAN12O95859 305 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 PSKH1P11801 424 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 SRCP12931 536 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ARNTP27540 789 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 DCTP40126 519 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 MAP2K4P45985 399 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.62□□□□□ -1.03
GPBP1-208ENST00000514387 FBXW5Q969U6 566 aa8.62□□□□□ -1.03
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