RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512677.1

PIK3R4-208, Transcript of phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PIK3R4, Length 744 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PIK3R4-208	ENST00000512677	TUBB3	Q13509	450 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SEMA3A	Q14563	771 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	BRD3	Q15059	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	KYNU	Q16719	465 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	DUPD1	Q68J44	220 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPESP1	Q6UW49	350 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	DTX1	Q86Y01	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	RSC1A1	Q92681	617 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	DLG3	Q92796	817 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	NACC2	Q96BF6	587 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	BIRC8	Q96P09	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	OR6C1	Q96RD1	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	HGH1	Q9BTY7	390 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	NLN	Q9BYT8	704 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	BRD7	Q9NPI1	651 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	FGF21	Q9NSA1	209 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PADI1	Q9ULC6	663 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SNX24	Q9Y343	169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	C9orf172	C9J069	976 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677		C9J4A7	227 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677		K7ENP7	123 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	MSTN	O14793	375 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAD51C	O43502	376 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	RAD1	O60671	282 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SCRG1	O75711	98 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	STK17B	O94768	372 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	MATN4	O95460	622 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	C1orf105	O95561	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRSS56	P0CW18	603 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ITGB6	P18564	788 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ITIH1	P19827	911 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	MPST	P25325	297 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ARNT	P27540	789 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ELK3	P41970	407 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLC1A2	P43004	574 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SEPHS1	P49903	392 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	HNMT	P50135	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PLTP	P55058	493 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	GFER	P55789	205 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ITGA1	P56199	1179 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CLDN6	P56747	220 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SKP1	P63208	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	POU4F1	Q01851	419 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CFHR1	Q03591	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TLE3	Q04726	772 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	ABR	Q12979	859 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	PRKG2	Q13237	762 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CTBP1	Q13363	440 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	CUL1	Q13616	776 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PIK3R4-208	ENST00000512677	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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