RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TCN2P20062 427 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MCM3P25205 808 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNFP41002 786 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA1P56199 1179 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL4CP56559 192 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKB2Q00653 900 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 IL10RAQ13651 578 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DSELQ8IZU8 1212 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF843Q8N446 348 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PPFIBP2Q8ND30 876 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO36Q8NEA4 188 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MR1Q95460 341 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CLIP3Q96DZ5 547 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TCTN2Q96GX1 697 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FOPNLQ96NB1 174 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MIPEPQ99797 713 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CHST8Q9H2A9 424 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL8Q9H568 366 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA7Q9P0W8 599 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PADI1Q9ULC6 663 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PSAT1Q9Y617 370 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 E7EQ34 232 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 E7ESA3 106 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF749O43361 778 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 AHSGP02765 367 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ERV3-1Q14264 604 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SUSD1Q6UWL2 747 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN12Q6ZSI9 719 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 HMGCLL1Q8TB92 370 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 WBP1Q96G27 269 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PKP4Q99569 1192 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NAT9Q9BTE0 207 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC6A20Q9NP91 592 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS7Q9Y394 339 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TK2O00142 265 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SMAPO00193 183 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS26AO75436 327 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PIAS1O75925 651 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2B3O76000 313 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CAPN1P07384 714 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIA3P42263 894 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TRADDQ15628 312 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2A13Q16696 494 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB109BQ30KR1 87 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC23LQ6PF05 361 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CYHR1Q6ZMK1 362 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM151BQ8IW70 566 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBED8Q8IZ13 594 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2L3Q8NG85 312 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9A1PQ8NGU1 263 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 DLG3Q92796 817 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 INPP5DQ92835 1189 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 LRFN5Q96NI6 719 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 OLFM1Q99784 485 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ERP44Q9BS26 406 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SYTL2Q9HCH5 934 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 COMMD10Q9Y6G5 202 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC14CA4D256 554 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM187AA6NFU0 413 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MEN1O00255 615 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CTSVO60911 334 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A8O95907 504 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CATP04040 527 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 MPC1LP0DKB6 136 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CBSLP0DN79 551 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 CBSP35520 551 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 POLE2P56282 527 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXL2P58012 376 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A5Q14940 896 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 SF1Q15637 639 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf189Q5VU69 101 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-218ENST00000511185 BORAQ6PGQ7 559 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms