RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509018.5

RAPGEF6-208, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 8,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ELOA3Q8NG57 546 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 OLFM3Q96PB7 478 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 STMN3Q9NZ72 180 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CIB4A0PJX0 185 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 MFN2O95140 757 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PGAM2P15259 253 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TNFRSF1BP20333 461 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC6A2P23975 617 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SOX2P48431 317 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ALG11Q2TAA5 492 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 LIPMQ5VYY2 423 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 BBS12Q6ZW61 710 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TEPSINQ96N21 525 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 STRA6Q9BX79 667 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRIM2Q9C040 744 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SNX4O95219 450 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SEC24AO95486 1093 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GNRH1P01148 92 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 DPP4P27487 766 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 MAP4K2Q12851 820 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 NR1D2Q14995 579 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PARP15Q460N3 678 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PJA1Q8NG27 643 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.261e-7■■■■□ 20.2
RAPGEF6-208ENST00000509018 PLD4Q96BZ4 506 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SH3GL3Q99963 347 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 H3BML4 177 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 KCNJ13O60928 360 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCNCP24863 283 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 NR2C2P49116 596 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 LIPEQ05469 1076 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 RUNX3Q13761 415 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 PDK4Q16654 411 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 RAET1LQ5VY80 246 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GKN2Q86XP6 184 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.263e-8■■■■■ 44
RAPGEF6-208ENST00000509018 COL21A1Q96P44 957 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 A0A1B0GV50 99 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRIM38O00635 465 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 CASKO14936 926 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM11P17152 192 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 IL4RP24394 825 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GPD2P43304 727 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR2B6P58173 313 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SCARB2Q14108 478 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 GPR153Q6NV75 609 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 AHSA2Q719I0 299 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM9CQ8IZT9 166 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FUKQ8N0W3 1084 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 SIX4Q9UIU6 781 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 LCHNA4D1U4 455 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TSPAN4O14817 238 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 STK16O75716 305 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 FABP3P05413 133 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 UFM1P61960 85 aa7.19□□□□□ -1.26
RAPGEF6-208ENST00000509018 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms