RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RAPH1Q70E73 1250 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 BMPERQ8N8U9 685 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 TEKT1Q969V4 418 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB9Q96C00 473 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SNX25Q9H3E2 840 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PN81 502 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LRRD1A4D1F6 860 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR3BO75015 233 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6AP2O75787 350 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 GOSR1O95249 250 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NTN1O95631 604 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FGF5P12034 268 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 EPORP19235 508 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 JAK1P23458 1154 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TNFRSF8P28908 595 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA7P36544 502 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 STX1BP61266 288 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PTGISQ16647 500 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 OR7G3Q8NG95 312 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 S1PR5Q9H228 398 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PRAC2D3DTV9 90 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf97H3BN30 126 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN9O14815 690 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SNX3O60493 162 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PIGNO95427 931 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 GSRP00390 522 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 EEF2P13639 858 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA2P29317 976 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CLDN15P56746 228 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PHKG1Q16816 387 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM139Q8IV31 216 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 HSD17B8Q92506 261 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 RIT1Q92963 219 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF583Q96ND8 569 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 Q9H8V8 135 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ECHDC1Q9NTX5 307 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM64BA6NI03 449 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ACOT8O14734 319 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PPIP5K2O43314 1243 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SELENOFO60613 162 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CETPP11597 493 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 MSH3P20585 1137 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DGKAP23743 735 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ASIC1P78348 528 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF415Q09FC8 603 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TAF13Q15543 124 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TAZQ16635 292 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SPSB3Q6PJ21 355 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 AK8Q96MA6 479 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ARPC2O15144 300 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 HNF4AP41235 474 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CDH11P55287 796 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 GSDMDP57764 484 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA6P61647 398 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LGALS3BPQ08380 585 aa7.11□□□□□ -1.27
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