RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	SPOCK1	Q08629	439 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CTBP1	Q13363	440 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	GRM7	Q14831	915 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RAB11B	Q15907	218 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SNAPC1	Q16533	368 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ME3	Q16798	604 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PCK2	Q16822	640 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	HES5	Q5TA89	166 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	GPR157	Q5UAW9	335 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ARSK	Q6UWY0	536 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MED25	Q71SY5	747 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ADCK2	Q7Z695	626 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	S100A7A	Q86SG5	101 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	FADS6	Q8N9I5	356 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BEST2	Q8NFU1	509 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OR2L3	Q8NG85	312 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RAET1E	Q8TD07	263 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MIB2	Q96AX9	1013 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OMA1	Q96E52	524 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PBK	Q96KB5	322 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BTBD9	Q96Q07	612 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SSX3	Q99909	188 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MECR	Q9BV79	373 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SLC22A4	Q9H015	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	OLAH	Q9NV23	265 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	RDH8	Q9NYR8	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	KCND2	Q9NZV8	630 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MID2	Q9UJV3	735 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CDH9	Q9ULB4	789 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CDYL	Q9Y232	598 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NR2E1	Q9Y466	385 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1W2PR77	199 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PIPSL	A2A3N6	862 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	BECN2	A8MW95	431 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398		H7C0C1	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD28	O15084	1053 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	MDM4	O15151	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF208	O43345	1280 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	UGDH	O60701	494 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SMIM24	O75264	130 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	USP12	O75317	370 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	VPS26A	O75436	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	NXPH2	O95156	264 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	UNC5C	O95185	931 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	AMY2A	P04746	511 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	IFNA6	P05013	189 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CFI	P05156	583 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	PGK2	P07205	417 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	CTSB	P07858	339 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TTC3-214	ENST00000472398	SPATA31D3	P0C874	917 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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