RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465848.1

DEGS1-204, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

TSL 2

Gene DEGS1, Length 633 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-204ENST00000465848 SMIM18P0DKX4 95 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 SKILP12757 684 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 CPA3P15088 417 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 EPCAMP16422 314 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 DNAJB1P25685 340 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 CDKN1AP38936 164 aa3.35□□□□□ -1.87
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DEGS1-204ENST00000465848 SULT1E1P49888 294 aa3.35□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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DEGS1-204ENST00000465848 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
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DEGS1-204ENST00000465848 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.35□□□□□ -1.87
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DEGS1-204ENST00000465848 STAG3L1P0CL83 205 aa3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.34□□□□□ -1.87
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DEGS1-204ENST00000465848 PTGER4P35408 488 aa3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 PLCD1P51178 756 aa3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 MMP15P51511 669 aa3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 MTTPP55157 894 aa3.34□□□□□ -1.87
DEGS1-204ENST00000465848 TUBA4AP68366 448 aa3.34□□□□□ -1.87
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