RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	OPTC	Q9UBM4	332 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	9.1	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIPSL	A2A3N6	862 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CPED1	A4D0V7	1026 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT87P	A6NCN2	255 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR6C74	A6NCV1	312 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	C2orf74	A8MZ97	194 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	KATNA1	O75449	491 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SUPT7L	O94864	414 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR47	O94967	919 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCNDBP1	O95273	360 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	FKBP9	O95302	570 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	MLYCD	O95822	493 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINE1	P05121	402 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	PROS1	P07225	676 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPB42	P16452	691 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CKMT2	P17540	419 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINB5	P36952	375 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC6A12	P48065	614 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	AGTR2	P50052	363 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAGLU	P54802	743 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBPL1	P62380	186 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPLD1	P80108	840 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIR2DS3	Q14952	304 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATG16L1	Q676U5	607 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	LCTL	Q6UWM7	567 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAXD	Q8IW45	347 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR10G6	Q8NH81	332 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNDP1	Q96KN2	507 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM237	Q96Q45	408 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC6	Q99741	560 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRMO	Q9BU70	441 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	SGPP1	Q9BX95	441 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		9.09	□□□□□ -0.95
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	GSAP	A4D1B5	854 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR5K3	A6NET4	321 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	ISM1	B1AKI9	464 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM114	B3SHH9	223 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	E2F3	O00716	465 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLF11	O14901	512 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	GIPC1	O14908	333 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLGN	O14967	610 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	DUX1	O43812	170 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	SH3BP5	O60239	455 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPHS1	O60500	1241 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	GP1BA	P07359	652 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	BGN	P21810	368 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	HRH2	P25021	359 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALDH4A1	P30038	563 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	GDF5	P43026	501 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	LIMK1	P53667	647 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	ABAT	P80404	500 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLC	Q05315	142 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC16	Q13042	620 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	STX3	Q13277	289 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	GTF2H2	Q13888	395 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAA25	Q14CX7	972 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHI3L2	Q15782	390 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDK4	Q16654	411 aa		9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96
SH3BP4-208	ENST00000462602	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	9.08	□□□□□ -0.96

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