RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 S1PR4O95977 384 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHEP01854 428 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL22P35268 128 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 GCGRP47871 477 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 TTPAP49638 278 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NR6A1Q15406 480 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 FCRL6Q6DN72 434 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCKQ8N0W5 287 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 GSDMBQ8TAX9 411 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR7Q8TB68 274 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 DLG3Q92796 817 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PAK5Q9P286 719 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC23Q9UJX2 597 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1B0GX78 115 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 A1L4Q6 167 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ALOX12BO75342 701 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NDUFS3O75489 264 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA3P26006 1051 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 BDKRB1P46663 353 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ARSFP54793 590 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS6KA1Q15418 735 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PCID2Q5JVF3 399 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 TTC23LQ6PF05 361 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CES3Q6UWW8 571 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OVCH1Q7RTY7 1134 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 INPP5DQ92835 1189 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX13Q92968 403 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 MIPEPQ99797 713 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 P2RY12Q9H244 342 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OCEL1Q9H607 264 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 TREX1Q9NSU2 369 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CUTCQ9NTM9 273 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CTSFQ9UBX1 484 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NFS1Q9Y697 457 aa9.88□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 AGPSO00116 658 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 DSCR3O14972 297 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NRP2O60462 931 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL41O60662 606 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CTSVO60911 334 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CBX6O95503 412 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 MMP11P24347 488 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 PSMB5P28074 263 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NMBRP28336 390 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC25BP30305 580 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OR1D4P47884 311 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SOX8P57073 446 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 GRM7Q14831 915 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 NKG7Q16617 165 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 HIF1AQ16665 826 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CNSTQ6PJW8 725 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 COX15Q7KZN9 410 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 CUZD1Q86UP6 607 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 MPP5Q8N3R9 675 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-206ENST00000446904 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms