RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CAPSQ13938 189 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF627Q7L945 461 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SSX6Q7RTT6 188 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FAM124AQ86V42 546 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MYNNQ9NPC7 610 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ADGRE1Q14246 886 aa6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 NEMP2A6NFY4 417 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 TP73O15350 636 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 CLEC3AO75596 197 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 XKRXQ6PP77 449 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ACDQ96AP0 544 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 ZNF358Q9NW07 568 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 STBD1O95210 358 aa6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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USP46-201ENST00000441222 NUDT13Q86X67 352 aa6.54□□□□□ -1.36
USP46-201ENST00000441222 PLD5Q8N7P1 536 aa6.54□□□□□ -1.36
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