RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM270Q6UE05 265 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPSTI1Q96J88 318 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNK13Q9HB14 408 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGA10O75578 1167 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTF2H1P32780 548 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FANCCQ00597 558 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEA1Q16626 185 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFIL3Q16649 462 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM205Q6UW68 189 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNPPD1Q9BV87 410 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUTCQ9NTM9 273 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTN3A3O00478 584 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTN3A1O00481 513 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALCAP01258 141 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SULT1E1P49888 294 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARFIP2P53365 341 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XRCC4Q13426 336 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PARP15Q460N3 678 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRILQ7L0X0 811 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SARAFQ96BY9 339 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMD13Q9UNM6 376 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC25A16P16260 332 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYB561P49447 251 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCNN1BP51168 640 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD1Q15327 319 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTBD16Q32M84 506 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEF8Q6ZN54 512 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REC114Q7Z4M0 266 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THAP2Q9H0W7 228 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf74A8MZ97 194 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HS3ST1O14792 307 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL18BPO95998 194 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL2RAP01589 272 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTPS1P17812 591 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMPD1P23109 780 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFS1P28331 727 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OPRM1P35372 400 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HILS1P60008 231 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDCLQ13371 301 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAZQ16635 292 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR59Q6PJI9 974 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC5A8Q8N695 610 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D31Q96DN5 1066 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EURLQ9NYK6 297 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOCK7Q96N67 2140 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 J3KR12 359 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRAMEF11O60813 436 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPPINO95925 133 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NR3C1P04150 777 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MXI1P50539 228 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSCR9P59020 149 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms