RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429940.6

LINC00839-202, long intergenic non-protein coding RNA 839, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00839, Length 2,253 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00839-202ENST00000429940 INPP5KQ9BT40 448 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 SERHLQ9NQF3 203 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 IL17CQ9P0M4 197 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ILVBLA1L0T0 632 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 MT-ND2P03891 347 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 EBLN1P0CF75 366 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 MASP1P48740 699 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 DAPP51397 102 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 SGSHP51688 502 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 PGS1Q32NB8 556 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 LINGO4Q6UY18 593 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 CEP68Q76N32 757 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ANKRD46Q86W74 232 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 DENND1CQ8IV53 801 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 HPS1Q92902 700 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 BOCQ9BWV1 1114 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 NACA2Q9H009 215 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00839-202ENST00000429940 MTMR11A4FU01 709 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ZBBXA8MT70 800 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 H0Y626 953 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SYN3O14994 580 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TRIM16O95361 564 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PRAMEF12O95522 483 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DGKAP23743 735 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 S100A3P33764 101 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 HOXD12P35452 270 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CXCR4P61073 352 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 GBX1Q14549 363 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 INAVAQ3KP66 663 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SVOPQ8N4V2 548 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 EID2BQ96D98 161 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SPATA17Q96L03 361 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 APOL4Q9BPW4 351 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 NTMT1Q9BV86 223 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RMND5AQ9H871 391 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PARVBQ9HBI1 364 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 WNT9AO14904 365 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RGS10O43665 173 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FAM20BO75063 409 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CKBP12277 381 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 EPB42P16452 691 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CTPS1P17812 591 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ARF5P84085 180 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ABHD18Q0P651 414 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 NCEH1Q6PIU2 408 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 SNX20Q7Z614 316 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 OR2T29Q8NH02 315 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 USP7Q93009 1102 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 BTBD2Q9BX70 525 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00839-202ENST00000429940 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms