RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOMEZQ8IX15 550 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4C6Q8NH72 309 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 MOCOSQ96EN8 888 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRMSQ9H3Y6 488 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMOC1Q9H4F8 434 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 IPPKQ9H8X2 491 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB26Q9HCK0 441 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSS2Q9NR19 701 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.4■□□□□ 0.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHRNGP07510 517 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PKNOX1P55347 436 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDH1Q08174 1060 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC16Q13042 620 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRKAA1Q13131 559 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBBP7Q16576 425 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCTLQ6UWM7 567 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSMEM2Q8N112 164 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX31Q8N9S9 440 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KYQ8NBH2 561 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF382Q96SR6 550 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HAUS8Q9BT25 410 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 XKR8Q9H6D3 395 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HAO1Q9UJM8 370 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAP2CQ9Y3L5 183 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.39■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LNP1A1A4G5 178 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LILRA5A6NI73 299 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPM1DO15297 605 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRP3O75074 770 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESRRBO95718 433 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMNAP02545 664 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNAZP19086 355 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARRB2P32121 409 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL35Q6PF15 583 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUZD1Q86UP6 607 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCEAL3Q969E4 200 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4K3Q96R72 315 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SORT1Q99523 831 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NTMT1Q9BV86 223 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPN3Q9H201 632 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DYRK1BQ9Y463 629 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR7A17O14581 309 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLGNO14967 610 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 UGDHO60701 494 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLB1P16278 677 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPPBP16860 134 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCR10P46092 362 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNG1P51959 295 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HK2P52789 917 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPHA4P54764 986 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SH3BP2P78314 561 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DS3Q14952 304 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 INAVAQ3KP66 663 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP11Q8TF27 550 aa16.38■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC38A3Q99624 504 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms