RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 HACD3Q9P035 362 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 VPS28Q9UK41 221 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PLLPQ9Y342 182 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 PSAT1Q9Y617 370 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.46□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CCL20-202ENST00000409189 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8RI6L899 631 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PLK4O00444 970 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SNX3O60493 162 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PIAS1O75925 651 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 APOA4P06727 396 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TAC1P20366 129 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PSMA3P25788 255 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HSD3B2P26439 372 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CSKP41240 450 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC1A2P43004 574 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CSNK1DP48730 415 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PLK1P53350 603 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RHOAP61586 193 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CXADRP78310 365 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TLE3Q04726 772 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RIN1Q13671 783 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC153Q494R4 210 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GPR158Q5T848 1215 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ATG16L1Q676U5 607 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SPATA21Q7Z572 469 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CLEC14AQ86T13 490 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 D2HGDHQ8N465 521 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.46□□□□□ -1.38
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CCL20-202ENST00000409189 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WDR48Q8TAF3 677 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FIBINQ8TAL6 211 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RDH11Q8TC12 318 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DDI1Q8WTU0 396 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WBP2Q969T9 261 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 E2F7Q96AV8 911 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C7orf26Q96N11 449 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LHX3Q9UBR4 397 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 VPS51Q9UID3 782 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MYLKQ15746 1914 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 A0A087X1B8 175 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PQ67 120 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LDB2O43679 373 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN3O60637 253 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 VAPBO95292 243 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TGDSO95455 350 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IGSF6O95976 241 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GSRP00390 522 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ASLP04424 464 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ARSAP15289 507 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TPH1P17752 444 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CRABP2P29373 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TYK2P29597 1187 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FOXN2P32314 431 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IGFALSP35858 605 aa6.45□□□□□ -1.38
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