RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CHADLQ6NUI6 762 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A8Q8IWU4 369 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PHC3Q8NDX5 983 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ITFG2Q969R8 447 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RMI1Q9H9A7 625 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ASB3Q9Y575 518 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 URADA6NGE7 173 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CBSLP0DN79 551 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CBSP35520 551 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F8P98187 520 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF404Q494X3 552 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP206Q8IYR0 622 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 BTN3A3O00478 584 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 STK25O00506 426 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOX3O15254 700 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MYF6P23409 242 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CSKP41240 450 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 UBE2QL1A1L167 161 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CHRNA6Q15825 494 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB6Q15916 424 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CES5AQ6NT32 575 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 BRI3BPQ8WY22 251 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RFKQ969G6 155 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 EHD1Q9H4M9 534 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 36.3
CTDSP2-201ENST00000398073 GKN1Q9NS71 199 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SNTG1Q9NSN8 517 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ARMC1Q9NVT9 282 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ACADMP11310 421 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RORCP51449 518 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SCARB2Q14108 478 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 OXR1Q8N573 874 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNC2Q96PR1 638 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 KDELR3O43731 214 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 EDN1P05305 212 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 BCAP31P51572 246 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RGS1Q08116 209 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 C5orf22Q49AR2 442 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM46CQ5VWP2 391 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SYVN1Q86TM6 617 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 L3HYPDHQ96EM0 354 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MYRFLQ96LU7 910 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM8Q9BZR9 551 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 FABP12A6NFH5 140 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 STT3AP46977 705 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CLCN4P51793 760 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 GRB14Q14449 540 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBA3EQ6PEY2 450 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC22A16Q86VW1 577 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 NAT16Q8N8M0 369 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 FERD3LQ96RJ6 166 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 HEPHQ9BQS7 1158 aa16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 ISM1B1AKI9 464 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 AGRPO00253 132 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 PFKMP08237 780 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CDKN2DP55273 166 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 OR2B6P58173 313 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 C1QTNF8P60827 252 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 LGALS3BPQ08380 585 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 EFCAB11Q9BUY7 163 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 CD244Q9BZW8 370 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 DHRS7Q9Y394 339 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PRB8 838 aa15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA31D3P0C874 917 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms