RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 YIPF2Q9BWQ6 316 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SLC32A1Q9H598 525 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DYRK4Q9NR20 520 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 POLG2Q9UHN1 485 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SCML1Q9UN30 329 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 COQ6Q9Y2Z9 468 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.87□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM202A6NGA9 273 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 A8MUI8 341 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF33A8MVX0 844 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MID1O15344 667 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PEX11AO75192 247 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 STK16O75716 305 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR4F21O95013 312 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 EGFP01133 1207 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GPR89BP0CG08 455 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CD8BP10966 210 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DRD2P14416 443 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 LBPP18428 481 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ITGAXP20702 1163 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CYP2A7P20853 494 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DRD1P21728 446 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ACADLP28330 430 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PGM1P36871 562 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GPR1P46091 355 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CPA2P48052 419 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA7P48741 367 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RGS19P49795 217 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF33BQ06732 778 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 BNIP3Q12983 259 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 RPA4Q13156 261 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FGL2Q14314 439 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MAPRE2Q15555 327 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 GSTA3Q16772 222 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 WSCD2Q2TBF2 565 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 COQ5Q5HYK3 327 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 NXNQ6DKJ4 435 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 PNCKQ6P2M8 343 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 NEK5Q6P3R8 708 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZSR9 355 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DET1Q7L5Y6 550 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SNX32Q86XE0 403 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 FUNDC1Q8IVP5 155 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF547Q8IVP9 402 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CHPFQ8IZ52 775 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP24Q8N264 748 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OXR1Q8N573 874 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR4F6Q8NGB9 312 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR2T11Q8NH01 316 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR2L2Q8NH16 312 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 OR56A3Q8NH54 315 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 USP7Q93009 1102 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 ESAMQ96AP7 390 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 HIC2Q96JB3 615 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TEX101Q9BY14 249 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DPEP2Q9H4A9 486 aa5.86□□□□□ -1.47
C6orf48-208ENST00000395788 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms