RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GABRDO14764 452 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 UBXN11Q5T124 520 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TLR4O00206 839 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf21Q9H246 121 aa14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PRB8 838 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RHDQ02161 417 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF347Q96SE7 839 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BEX2Q9BXY8 128 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BEX1Q9HBH7 125 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CPQQ9Y646 472 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KAT6AQ92794 2004 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR14I1A6ND48 311 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GABBR2O75899 941 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP3A5P20815 502 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ISOC1Q96CN7 298 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MED31Q9Y3C7 131 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PITPNM1O00562 1244 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AHCYP23526 432 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 STT3AP46977 705 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 AP3S2P59780 193 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SULT2A1Q06520 285 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SHISA4Q96DD7 197 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 COL21A1Q96P44 957 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ATF6P18850 670 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ACVRL1P37023 503 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 LBX2Q6XYB7 198 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SNX20Q7Z614 316 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GRHL3Q8TE85 626 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF69Q9UC07 566 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NOTOA8MTQ0 251 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CDRT1O95170 752 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CSF2P04141 144 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 C8GP07360 202 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CES5AQ6NT32 575 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2T29Q8NH02 315 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2AG1Q9H205 316 aa14.91□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ADH1CP00326 375 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CSKP41240 450 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMU1Q2TAY7 513 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SPERTQ8NA61 448 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NFKBIDQ8NI38 313 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KCTD7Q96MP8 289 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 INMTO95050 263 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NSG1P42857 185 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TSPAN5P62079 268 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CAMK1Q14012 370 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MLXQ9UH92 298 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 BCHEP06276 602 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MAP2K4P45985 399 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF234Q14588 700 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CRY2Q49AN0 593 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL22Q53GT1 634 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF627Q7L945 461 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IFT46Q9NQC8 304 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC15A1P46059 708 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.8 ms