RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 PIK3CBP42338 1070 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 PMS2P54278 862 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 GEMP55040 296 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ACY1Q03154 408 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 PLCL1Q15111 1095 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 IGFBP7Q16270 282 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 RNF220Q5VTB9 566 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 SARM1Q6SZW1 724 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 DET1Q7L5Y6 550 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 OR2L2Q8NH16 312 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ACTL9Q8TC94 416 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF398Q8TD17 642 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 C12orf66Q96MD2 445 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 APOL2Q9BQE5 337 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 WWP1Q9H0M0 922 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 TSPY26PQ9H489 355 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 ACTL8Q9H568 366 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 PDE7BQ9NP56 450 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 FGF21Q9NSA1 209 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.77□□□□□ -1.32
CTXN3-201ENST00000379445 FLNCQ14315 2725 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 LRRK2Q5S007 2527 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 NBASA2RRP1 2371 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 C5orf60A6NFR6 353 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 C2orf81A6NN90 581 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PLOD3O60568 738 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 DNAJB5O75953 348 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 IGHA1P01876 353 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 NTRK1P04629 796 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 MSH3P20585 1137 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 CNTFP26441 200 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PSMB4P28070 264 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PTPN7P35236 360 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PRLHRP49683 370 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 TUBB4BP68371 445 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 HSD11B2P80365 405 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 KLRB1Q12918 225 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 TUBB2AQ13885 445 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 DAAM2Q86T65 1068 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 OOSP2Q86WS3 158 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 CARFQ8N187 725 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 FAM13CQ8NE31 585 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 HM13Q8TCT9 377 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 MIB2Q96AX9 1013 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 RUBCNLQ9H714 662 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ASB8Q9H765 288 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 BTRCQ9Y297 605 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PIPSLA2A3N6 862 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 OR6C74A6NCV1 312 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 H7C0C1 242 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 J3QW42 95 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 LDB2O43679 373 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 PTPN4P29074 926 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ECI1P42126 302 aa6.76□□□□□ -1.33
CTXN3-201ENST00000379445 ATP5OP48047 213 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms