RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00596Q86U02 117 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YAF2Q8IY57 180 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR137CQ8N3F9 429 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STPG2Q8N412 459 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C9orf62Q8N4C0 152 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARRDC1Q8N5I2 433 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC33Q8N5R6 958 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C11orf42Q8N5U0 333 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPEPL1Q8NDH3 523 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR10D4PQ8NGN7 298 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATL2Q8NHH9 583 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C7orf33Q8WU49 177 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTR3CQ8WXA8 447 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXT2Q93063 718 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHYHIPLQ96FC7 376 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCNAQ96QF7 691 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UIMC1Q96RL1 719 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIP5K1AQ99755 562 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OLFM1Q99784 485 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXB1Q99853 325 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WWP1Q9H0M0 922 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKIP1Q9NQ31 210 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM36Q9NQ86 728 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPATCH2Q9NW75 528 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRSS50Q9UI38 385 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDH22Q9UJ99 828 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASAL2Q9UJF2 1139 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPREB3Q9UKI3 123 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRDM4Q9UKN5 801 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00588Q9Y4M8 146 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACTL7AQ9Y615 435 aa-3.76□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOA2Q15596 1464 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANHXE9PGG2 379 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDXKO00764 312 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNB5O14775 395 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TREHO43280 583 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TGM5O43548 720 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ECE2O60344 883 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GATBO75879 557 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO1DO94832 1006 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFB8O95169 186 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF20AO95235 890 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLIC3O95833 236 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGGP02679 453 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRYBA1P05813 215 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JMJD7P0C870 316 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EPXP11678 715 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNA6P17658 529 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCR7P32248 378 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPL4P36578 427 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PEX5P50542 639 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LUMP51884 338 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBE2E1P51965 193 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ENTPD8Q5MY95 495 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TAPT1Q6NXT6 567 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTFR2Q6P444 385 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAPRTQ6XQN6 538 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IDO2Q6ZQW0 420 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STOX1Q6ZVD7 989 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHD1LQ86WJ1 897 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC13Q8IYE1 715 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEPT12Q8IYM1 358 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBALD2Q8IYN6 164 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUP93Q8N1F7 819 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM116Q8NCL8 245 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM13CQ8NE31 585 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM170AQ8WVE7 144 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASB5Q8WWX0 329 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCE1Q969G3 411 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBXW7Q969H0 707 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LENG9Q96B70 501 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COA7Q96BR5 231 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYFIP2Q96F07 1278 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNRHR2Q96P88 292 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TESK2Q96S53 571 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NIF3L1Q9GZT8 377 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACTR8Q9H981 624 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLD4Q9HCU8 107 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa-3.77□□□□□ -3.01
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CISHQ9NSE2 258 aa-3.77□□□□□ -3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms