RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358506.6

PPP1CB-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PPP1CB, Length 4,771 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-202ENST00000358506 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 H3BNX3 289 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CCDC157Q569K6 752 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TMEM25Q86YD3 366 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ARHGEF9O43307 516 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ENGP17813 658 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CLCNKAP51800 687 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.187e-7■■□□□ 13.2
PPP1CB-202ENST00000358506 PTGR1Q14914 329 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC8B1Q6J4K2 584 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 KLHDC10Q6PID8 442 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PDSS2Q86YH6 399 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ARRDC2Q8TBH0 407 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 LRCH3Q96II8 777 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 NUAK2Q9H093 628 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 GABBR2O75899 941 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 BPIP17213 487 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 MAGEA3P43357 314 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CDH12P55289 794 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PARGQ86W56 976 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PTERQ96BW5 349 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 EXD2Q9NVH0 621 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 COQ6Q9Y2Z9 468 aa16.17■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 A0A1W2PRB8 838 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 NUDT14O95848 222 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 BIRC7Q96CA5 298 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 BOCQ9BWV1 1114 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ERGIC3Q9Y282 383 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 OR10H1Q9Y4A9 318 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TRIM24O15164 1050 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 GSRP00390 522 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 C1QTNF8P60827 252 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ITGADQ13349 1161 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 DAG1Q14118 895 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 KCTD11Q693B1 232 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 FIBINQ8TAL6 211 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ADAMDEC1O15204 470 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 UGT2B17O75795 530 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CTSAP10619 480 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ATF6P18850 670 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SEMA3BQ13214 749 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CCNIQ14094 377 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 DPP10Q8N608 796 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 IL17CQ9P0M4 197 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 NME7Q9Y5B8 376 aa16.16■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 COPZ1P61923 177 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 MGAT3Q09327 533 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 FAM26DQ5JW98 314 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TSPEARQ8WU66 669 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 MTERF3Q96E29 417 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 SLC38A2Q96QD8 506 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 IL23AQ9NPF7 189 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 OARD1Q9Y530 152 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 LRRC72A6NJI9 287 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
PPP1CB-202ENST00000358506 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms