RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TSTD1Q8NFU3 115 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MCUR1Q96AQ8 359 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PRDM6Q9NQX0 595 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SNX6Q9UNH7 406 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CA5BQ9Y2D0 317 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WDR37Q9Y2I8 494 aa15□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NPIPB8E9PQR5 432 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TNFRSF10CO14798 259 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RGS14O43566 566 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CD22P20273 847 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ITGAXP20702 1163 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PNLIPRP1P54315 467 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 IRF8Q02556 426 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 EMX2Q04743 252 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF33BQ06732 778 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CUL3Q13618 768 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NR6A1Q15406 480 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 KIF19Q2TAC6 998 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GK5Q6ZS86 529 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MIER2Q8N344 545 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PHC3Q8NDX5 983 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FAM13CQ8NE31 585 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WDR92Q96MX6 357 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 MENTQ9BUN1 341 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FOXQ1Q9C009 403 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM45AQ9NWC5 275 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 KCNK6Q9Y257 313 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 E7EQ34 232 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NPPBP16860 134 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CD6P30203 668 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PGM1P36871 562 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HALP42357 657 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GNPDA1P46926 289 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PAOXQ6QHF9 649 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RCN3Q96D15 328 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HHIPQ96QV1 700 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 OR2M4Q96R27 311 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 DMTF1Q9Y222 760 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.99□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 H0YIV9 168 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF217O75362 1048 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PDYNP01213 254 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GNAZP19086 355 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 IDSP22304 550 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PRPH2P23942 346 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HTR1BP28222 390 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT1P36639 197 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HSD17B2P37059 387 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 HNF4AP41235 474 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RAP1GDS1P52306 607 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 STX5Q13190 355 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RIPK1Q13546 671 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 DOC2AQ14183 400 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 XKR6Q5GH73 641 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FRG2Q64ET8 278 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SIX5Q8N196 739 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 KYQ8NBH2 561 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 WDR34Q96EX3 536 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 PDXPQ96GD0 296 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 FRG2BQ96QU4 278 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 ACPTQ9BZG2 426 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMS1-202ENST00000338045 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms