RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334490.5

C9orf47-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf47, Length 4,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-201ENST00000334490 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 SLC38A4Q969I6 547 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 ROPN1LQ96C74 230 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 GDE1Q9NZC3 331 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 EDIL3O43854 480 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 SCELO95171 688 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 GJA8P48165 433 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FAM234BA2RU67 622 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 SEC24AO95486 1093 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 CTSKP43235 329 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 TRIM16LQ309B1 348 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 SFRP1Q8N474 314 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FAM13CQ8NE31 585 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FAM3CQ92520 227 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 CITO14578 2027 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 TMEM233B4DJY2 109 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PRMT3O60678 531 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 REM1O75628 298 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 CASP9P55211 416 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 MTPNP58546 118 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FBXO43Q4G163 708 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 MYDGFQ969H8 173 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 DHRS7Q9Y394 339 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 TNFRSF11BO00300 401 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 DNAJA2O60884 412 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FABP3P05413 133 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 CEBPBP17676 345 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PRDX6P30041 224 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 FGF13Q92913 245 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 PEX13Q92968 403 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 OR51B5Q9H339 312 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 MUC13Q9H3R2 512 aa14.65□□□□□ -0.06
C9orf47-201ENST00000334490 MID1O15344 667 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ADAM12O43184 909 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ITGA1P56199 1179 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SPIN4Q56A73 249 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NEK5Q6P3R8 708 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CCDC103Q8IW40 242 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 XKR8Q9H6D3 395 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MFN2O95140 757 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PFKLP17858 780 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CCKBRP32239 447 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 BNIP1Q12981 228 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PIK3C3Q8NEB9 887 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRPV3Q8NET8 790 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FAM110BQ8TC76 370 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MTG2Q9H4K7 406 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NEK6Q9HC98 313 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRIM24O15164 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 C5AR1P21730 350 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 SP140Q13342 867 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 DCST1Q5T197 706 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 RINLQ6ZS11 566 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CHST14Q8NCH0 376 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MAPK15Q8TD08 544 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 CIB1Q99828 191 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TAF1P21675 1872 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 COL18A1P39060 1754 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 C6P13671 934 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NCK1P16333 377 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 GGT5P36269 586 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 KHKP50053 298 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 MIEF2Q96C03 454 aa14.64□□□□□ -0.07
C9orf47-201ENST00000334490 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 313.5 ms