RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 ASF1BQ9NVP2 202 aa20.29■□□□□ 0.84
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SOCS1-201ENST00000332029 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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SOCS1-201ENST00000332029 KIFC1Q9BW19 673 aa20.27■□□□□ 0.84
SOCS1-201ENST00000332029 HOMER3Q9NSC5 361 aa20.27■□□□□ 0.84
SOCS1-201ENST00000332029 SYBUQ9NX95 663 aa20.27■□□□□ 0.84
SOCS1-201ENST00000332029 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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SOCS1-201ENST00000332029 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 CXCR5P32302 372 aa20.26■□□□□ 0.83
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SOCS1-201ENST00000332029 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.25■□□□□ 0.83
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SOCS1-201ENST00000332029 S1PR4O95977 384 aa20.25■□□□□ 0.83
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SOCS1-201ENST00000332029 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.25■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 PRELID2Q8N945 189 aa20.25■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 DLG3Q92796 817 aa20.25■□□□□ 0.83
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SOCS1-201ENST00000332029 AGPSO00116 658 aa20.24■□□□□ 0.83
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SOCS1-201ENST00000332029 Q6ZS92 163 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SOCS1-201ENST00000332029 SOX13Q9UN79 622 aa20.24■□□□□ 0.83
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