RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FIGLAQ6QHK4 219 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 NLRP9Q7RTR0 991 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CUZD1Q86UP6 607 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 HES6Q96HZ4 224 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 C5orf34Q96MH7 638 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MENTQ9BUN1 341 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB6BQ9NRW1 208 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CATSPERZQ9NTU4 200 aa24.03■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CACNA1DQ01668 2161 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 RASGRF2O14827 1237 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 DSCR3O14972 297 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GPC4O75487 556 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 COL8A1P27658 744 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GCGRP47871 477 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SOX8P57073 446 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 ACVR1Q04771 509 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SNX1Q13596 522 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GRB7Q14451 532 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 GRM7Q14831 915 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 HIF1AQ16665 826 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 FCRL6Q6DN72 434 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC23LQ6PF05 361 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 Q6ZS92 163 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 OVCH1Q7RTY7 1134 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 UNC79Q9P2D8 2635 aa24.02■■□□□ 1.44
PPP4R4-202ENST00000328839 LDLRP01130 860 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 APRTP07741 180 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ETS1P14921 441 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 AOAHP28039 575 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NKG7Q16617 165 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TCTE1Q5JU00 501 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC89Q8N998 374 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR54Q9H977 334 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CTSFQ9UBX1 484 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NTNG1Q9Y2I2 539 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.01■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SOCS6O14544 535 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CLDN1O95832 211 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ALBP02768 609 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 OR1D4P47884 311 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF787Q6DD87 383 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 COX15Q7KZN9 410 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NACC2Q96BF6 587 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SPSB2Q99619 263 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NOTCH2Q04721 2471 aa24■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SLCO2B1O94956 709 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PSMB5P28074 263 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 BDKRB1P46663 353 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TTPAP49638 278 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 RBBP7Q16576 425 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB42Q8N4Z0 105 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 OTUD6BQ8N6M0 293 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CNDP1Q96KN2 507 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 AGAP4Q96P64 663 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 PANX3Q96QZ0 392 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.99■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM139Q8IV31 216 aa23.98■■□□□ 1.43
PPP4R4-202ENST00000328839 DTWD1Q8N5C7 304 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms