RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM73Q86UV7 250 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 SMPDL3AQ92484 453 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 EXT2Q93063 718 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 EGFL8Q99944 293 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 ATG10Q9H0Y0 220 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 RNF112Q9ULX5 631 aa21.58■■□□□ 1.05
HOXD4-201ENST00000306324 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC187A0A096LP49 1063 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA8RI6L899 631 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 HGSO14964 777 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MT-ND3P03897 115 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PSMB5P28074 263 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RASA2Q15283 850 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 C3orf38Q5JPI3 329 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KLC3Q6P597 504 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 AGTRAPQ6RW13 159 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RAB11FIP2Q7L804 512 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ISCA2Q86U28 154 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 GPSM1Q86YR5 675 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4X1Q8N118 509 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 STAG3L4Q8TBR4 150 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MZB1Q8WU39 189 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CABS1Q96KC9 395 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CMKLR1Q99788 373 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 EURLQ9NYK6 297 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 E7ENX8 843 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ANXA5P08758 320 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD34CP0C6C1 535 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TAP2Q03519 686 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TGFBIQ15582 683 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FAM20CQ8IXL6 584 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 AGBL5Q8NDL9 886 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MED8Q96G25 268 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KLHL25Q9H0H3 589 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF358Q9NW07 568 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SATB2Q9UPW6 733 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PPM1 405 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PPV9 198 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 HGFP14210 728 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PVRP15151 417 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 LSSP48449 732 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ARL4DP49703 201 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ACAP2Q15057 778 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FAM129CQ86XR2 697 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ATL1Q8WXF7 558 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL8Q96CD0 374 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 MIPEPQ99797 713 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CEP295Q9C0D2 2601 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 A0A0J9YY10 115 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 PYGBP11216 843 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 COL6A2P12110 1019 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 ST6GAL1P15907 406 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 KCNC1P48547 511 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TBPL1P62380 186 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CDKL1Q00532 357 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 NAE1Q13564 534 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HOXD4-201ENST00000306324 CARFQ8N187 725 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms