RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 OR1D2P34982 312 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CD300CQ08708 224 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ST3GAL4Q11206 333 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TUBA3CQ13748 450 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NFE2L1Q14494 772 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC36A3Q495N2 470 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 BBS4Q96RK4 519 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SIAEQ9HAT2 523 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PRELID1Q9Y255 219 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PAX3P23760 479 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TAZQ16635 292 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C10orf53Q8N6V4 93 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PIGKQ92643 395 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DSN1Q9H410 356 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 AIG1Q9NVV5 245 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MCUBQ9NWR8 336 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 AP3M1Q9Y2T2 418 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SELPLGQ14242 412 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 UGT8Q16880 541 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 Q6ZNX1 250 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TIGD4Q8IY51 512 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PPCDCQ96CD2 204 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ACBD6Q9BR61 282 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CARD8Q9Y2G2 431 aa15.35■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PRKAR1AP10644 381 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 UGT2B15P54855 530 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 AKIRIN2Q53H80 203 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ERAP2Q6P179 960 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SLC28A2O43868 658 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 IGSF6O95976 241 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HSD17B1P14061 328 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MAGEA6P43360 314 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CCL23P55773 120 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ITGA1P56199 1179 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PARP15Q460N3 678 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 DESI1Q6ICB0 168 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 BORAQ6PGQ7 559 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TBPL2Q6SJ96 375 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 ELMOD1Q8N336 334 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 LCHNA4D1U4 455 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 H0YAE9 185 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 SEPT4O43236 478 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GADD45GO95257 159 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GADD45AP24522 165 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MANFP55145 182 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GHRHRQ02643 423 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PON2Q15165 354 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 MYO19Q96H55 970 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 TBX5Q99593 518 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 FZD4Q9ULV1 537 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.34■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 A0A096LPI6 279 aa15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CDRT1O95170 752 aa15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 FCER2P06734 321 aa15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 IL10RBQ08334 325 aa15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 GPAT3Q53EU6 434 aa15.33■□□□□ 0.05
USP43-201ENST00000285199 CYBRD1Q53TN4 286 aa15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms