RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 NDUFS1P28331 727 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ELOCQ15369 112 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 CDYL2Q8N8U2 506 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.97■■□□□ 1.11
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UFD1-201ENST00000263202 PRAMEF4O60810 478 aa21.96■■□□□ 1.11
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UFD1-201ENST00000263202 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 CEP68Q76N32 757 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ZNF839A8K0R7 811 aa21.96■■□□□ 1.11
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UFD1-201ENST00000263202 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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UFD1-201ENST00000263202 HGFP14210 728 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 NPPBP16860 134 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 CCND1P24385 295 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 PKLRP30613 574 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.114e-6■■■□□ 18
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UFD1-201ENST00000263202 NAGSQ8N159 534 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 LMX1AQ8TE12 382 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 PATE1Q8WXA2 126 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 TUBB1Q9H4B7 451 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ACTR8Q9H981 624 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 MEAF6Q9HAF1 191 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 SPASTQ9UBP0 616 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 HEY2Q9UBP5 337 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 ICKQ9UPZ9 632 aa21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
UFD1-201ENST00000263202 OR5K4A6NMS3 321 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 RAB28P51157 221 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 INHBCP55103 352 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 PCDH1Q08174 1060 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 SFTPA2Q8IWL1 248 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.95■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 XKR8Q9H6D3 395 aa21.95■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.95■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 A0A0G2JNG1 304 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 E7EQ34 232 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 KIR2DS3K7RE56 304 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 SDHDO14521 159 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 EPHA3P29320 983 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 CTSKP43235 329 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 BNC1Q01954 994 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 KIR2DS5Q14953 304 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 GKN2Q86XP6 184 aa21.94■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 HMGCLL1Q8TB92 370 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 SMPDL3AQ92484 453 aa21.94■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 KNL1Q8NG31 2342 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.94■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 CLGNO14967 610 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 KDM1AO60341 852 aa21.94■■□□□ 1.1
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UFD1-201ENST00000263202 CHIT1Q13231 466 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 KIF19Q2TAC6 998 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 LCTLQ6UWM7 567 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.94■■□□□ 1.1
UFD1-201ENST00000263202 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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