RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 SDC1P18827 310 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HTR1BP28222 390 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PDHA2P29803 388 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SLC19A1P41440 591 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VBP1P61758 197 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RBFAQ8N0V3 343 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NXPE1Q8N323 547 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ING5Q8WYH8 240 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEM169Q96HH4 297 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB18Q99592 522 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CWH43Q9H720 699 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CREBZFQ9NS37 354 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GBF1Q92538 1859 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 COL4A6Q14031 1691 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 K7EPI3 171 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RGS14O43566 566 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VIPP01282 170 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ITGB8P26012 769 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 S100A3P33764 101 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DCTP40126 519 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RGS4P49798 205 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ALDH3A2P51648 485 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NUDT6P53370 316 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CYP4F2P78329 520 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VLDLRP98155 873 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C16orf87Q6PH81 154 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SNX20Q7Z614 316 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HM13Q8TCT9 377 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 ACDQ96AP0 544 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 E7EQ34 232 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 VPS4BO75351 444 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 LAMP1P11279 417 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SRCP12931 536 aa8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 CHIT1Q13231 466 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CDKN3Q16667 212 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HKDC1Q2TB90 917 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 SPARTQ8N0X7 666 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 NDNFQ8TB73 568 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.44□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.44□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 RFXANKO14593 260 aa8.43□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 DGKAP23743 735 aa8.43□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CTSCP53634 463 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TLE2Q04725 743 aa8.43□□□□□ -1.06
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GINS1-201ENST00000262460 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 TRIM60Q495X7 471 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 FATE1Q969F0 183 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS1-201ENST00000262460 PLD4Q96BZ4 506 aa8.43□□□□□ -1.06
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