RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FGF22Q9HCT0 170 aa20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MAN2B1O00754 1011 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 WFS1O76024 890 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CLCNKAP51800 687 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TBPL1P62380 186 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IRF8Q02556 426 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RPA4Q13156 261 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GAS6Q14393 721 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 XKR6Q5GH73 641 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 NR5A2O00482 541 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CCND1P24385 295 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ACADVLP49748 655 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ERFP50548 548 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 UFM1P61960 85 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GSTA3Q16772 222 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MRGBPQ9NV56 204 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 USP34Q70CQ2 3546 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KNL1Q8NG31 2342 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CFLARO15519 480 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KRT6AP02538 564 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KRT6BP04259 564 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GPR89BP0CG08 455 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC2A4P14672 509 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GNPDA1P46926 289 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KRT6CP48668 564 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RAP1GDS1P52306 607 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ART3Q13508 389 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MMEL1Q495T6 779 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 PYCR3Q53H96 274 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 REP15Q6BDI9 236 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 NUDT8Q8WV74 236 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 BMFQ96LC9 184 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ACPTQ9BZG2 426 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.5■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KRBA1A5PL33 1030 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC72A6NJI9 287 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CCR3P51677 355 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DOC2AQ14183 400 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MAPRE2Q15555 327 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IL23RQ5VWK5 629 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM69Q86WT6 500 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DEFB123Q8N688 67 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FRMD1Q8N878 549 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 E7ENX8 843 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 RGS14O43566 566 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SEMA4FO95754 770 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 G6PDP11413 515 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CAPN3P20807 821 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 DPP6P42658 865 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 TAP2Q03519 686 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 IMPG1Q17R60 797 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 LAYNQ6UX15 382 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 ASB12Q8WXK4 309 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 NEIL2Q969S2 332 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 FOXQ1Q9C009 403 aa20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.48■□□□□ 0.87
RFXAP-201ENST00000255476 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms