RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRB3P13945 408 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPN3P20807 821 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1DP48730 415 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BP2P78314 561 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD51Q06609 339 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRRQ15256 657 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 USP51Q70EK9 711 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PROSER1Q86XN7 944 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRDC2Q8TBH0 407 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 BIRC7Q96CA5 298 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 LRIG1Q96JA1 1093 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 COG8Q96MW5 612 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM6Q9BX84 2022 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC8Q9BY41 377 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SGK2Q9HBY8 427 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SCUBE2Q9NQ36 999 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DYRK4Q9NR20 520 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB23Q9ULC3 237 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3EA0A087X179 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3LB9A6J9 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-34P06331 123 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3HP0C7X1 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CD1DP15813 335 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMP2P16035 220 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CD97P48960 835 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 HLCSP50747 726 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA3CQ13748 450 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS26BQ4G0F5 336 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR150Q8NGU9 434 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CYGBQ8WWM9 190 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 COX4I2Q96KJ9 171 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM14Q96QK8 99 aa25.67■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TMBIM6P55061 237 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN2DP55273 166 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAF2Q12933 501 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MOGQ16653 247 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DDIASQ8IXT1 998 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM125Q96AQ2 219 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.66■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL12A8MUP2 240 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PIP5K1BO14986 540 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOBTB1O94844 696 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRP01130 860 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB39AQ14964 217 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP51A1Q16850 503 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP9P1Q75LS8 142 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK6Q92876 244 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 BDH2Q9BUT1 245 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG2Q9H553 416 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC52A3Q9NQ40 469 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV5S2A0A599 114 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PATE3B3GLJ2 98 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf142B7Z368 130 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CPNE6O95741 557 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP2P08253 660 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ACVR1Q04771 509 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL2L1Q07817 233 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 FXNQ16595 210 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CYBRD1Q53TN4 286 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM207Q6UWW9 146 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 DDHD1Q8NEL9 900 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX19Q92543 992 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGKQ92643 395 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ORAI3Q9BRQ5 295 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa25.65■■□□□ 1.7
CAPNS1-201ENST00000246533 EEDO75530 441 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ESRRBO95718 433 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK10P57789 538 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 PMS2P3Q13401 168 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LYSMD4Q5XG99 296 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG1LQ6GMV1 187 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 LAIR1Q6GTX8 287 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf74Q86VG3 221 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 NRBF2Q96F24 287 aa25.64■■□□□ 1.69
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
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