RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 FGF21Q9NSA1 209 aa21.5■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A8O95907 504 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MSL3P1P0C860 447 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PSMB5P28074 263 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ACY1Q03154 408 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TLE3Q04726 772 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TUBB3Q13509 450 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP19Q14CB8 494 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PHKG1Q16816 387 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 GRTP1Q5TC63 336 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 KCNE4Q8WWG9 221 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RNF31Q96EP0 1072 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 DPH1Q9BZG8 443 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 HMX2A2RU54 273 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 E7ENX8 843 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A5O15375 505 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 DLGAP3O95886 979 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 C8GP07360 202 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM153BP0C7A2 387 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LIPCP11150 499 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ARL4DP49703 201 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TUBB4BP68371 445 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 POU4F1Q01851 419 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TAP2Q03519 686 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM153CQ494X1 144 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FCRL6Q6DN72 434 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CEP128Q6ZU80 1094 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PARVBQ9HBI1 364 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PDE7BQ9NP56 450 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.48■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 H3BMH7 237 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RRP8O43159 456 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 EFSO43281 561 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MAGP20916 626 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 IMPA1P29218 277 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PNLIPRP1P54315 467 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 NAB1Q13506 487 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC22Q8N4W6 341 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 PPFIBP2Q8ND30 876 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 NKD1Q969G9 470 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TXLNGYQ9BZA5 131 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.47■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1BQ00975 2339 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 STMND1H3BQB6 276 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 KLK10O43240 276 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 STK17BO94768 372 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ACSL3O95573 720 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CTSBP07858 339 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MYBL2P10244 700 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SPRP35270 261 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 CSRP3P50461 194 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SP140Q13342 867 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SBSNQ6UWP8 590 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 OR1L3Q8NH93 324 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 SMPDL3AQ92484 453 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TCTN2Q96GX1 697 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 RARRES3Q9UL19 164 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 ITPR1Q14643 2758 aa21.46■■□□□ 1.03
SYF2-201ENST00000236273 LOC400499M0QZD8 3231 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 CDC7O00311 574 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 GMPRP36959 345 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B2P37059 387 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 GRIA3P42263 894 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3AQ16821 1122 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TEX35Q5T0J7 233 aa21.45■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms