RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 CPQQ9Y646 472 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PTPRJQ12913 1337 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ISM1B1AKI9 464 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FPGTO14772 594 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 AQP9O43315 295 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SSX5O60225 188 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HLA-DPB1P04440 258 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 IL7RP16871 459 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FPR1P21462 350 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PKLRP30613 574 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SCNN1AP37088 669 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PTPN9P43378 593 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CLCQ05315 142 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PTGR1Q14914 329 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CPTPQ5TA50 214 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 KANK2Q63ZY3 851 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FSTL4Q6MZW2 842 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PIGZQ86VD9 579 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NATD1Q8N6N6 113 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR10A6Q8NH74 314 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CENPOQ9BU64 300 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF639Q9UID6 485 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGA12O60330 932 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 RFPL3O75679 317 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 EOMESO95936 686 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SELPP16109 830 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 GLUD2P49448 558 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SOX10P56693 466 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CDKL1Q00532 357 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NDUFA9Q16795 377 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MPP7Q5T2T1 576 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TSPEARQ8WU66 669 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NXPE2Q96DL1 559 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TTPALQ9BTX7 342 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 WRBO00258 174 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FFAR3O14843 346 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 GPR42O15529 346 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CDRT1O95170 752 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NFATC1O95644 943 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 NR4A2P43354 598 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CDH8P55286 799 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R41P59536 307 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SSX2Q16385 188 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 OR2T29Q8NH02 315 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 STYXQ8WUJ0 223 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 P2RY11Q96G91 374 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MYO19Q96H55 970 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf109Q9NX04 203 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 COPZ2Q9P299 210 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.74□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1B0GVI7 797 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TGFB1I1O43294 461 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 AP2A1O95782 977 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 APODP05090 189 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 HSD17B2P37059 387 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CACNG1Q06432 222 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 CLCA4Q14CN2 919 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 TAF13Q15543 124 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 C4orf46Q504U0 113 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 MBLAC2Q68D91 279 aa6.73□□□□□ -1.33
CLCN3-211ENST00000613795 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms