RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597151.1

LTBP4-217, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene LTBP4, Length 285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-217ENST00000597151 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 VPS4AQ9UN37 437 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.71□□□□□ -0.05
LTBP4-217ENST00000597151 PTPN13Q12923 2485 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 DPM1O60762 260 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 NDUFS3O75489 264 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 ALAS2P22557 587 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 NMBRP28336 390 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FOLR3P41439 243 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 UQCRFS1P47985 274 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 NPY2RP49146 381 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FOXL2P58012 376 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GRB7Q14451 532 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MENTQ9BUN1 341 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 IL22Q9GZX6 179 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TREX1Q9NSU2 369 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 BFARQ9NZS9 450 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 LUZP4Q9P127 313 aa14.7□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 PEX12O00623 359 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 S1PR4O95977 384 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FGGP02679 453 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CD63P08962 238 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GNLYP22749 145 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GRIA3P42263 894 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 KCNJ1P48048 391 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 C4orf22Q6V702 233 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 PTERQ96BW5 349 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 IP6K3Q96PC2 410 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 PANX3Q96QZ0 392 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 P2RY12Q9H244 342 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SEC16AO15027 2179 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MED13Q9UHV7 2174 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 PCSK5Q92824 1860 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 AP3B1O00203 1094 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 RASGRF2O14827 1237 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MGAT1P26572 445 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TERF1P54274 439 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 DCAF10Q5QP82 559 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FCRL6Q6DN72 434 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TTC23LQ6PF05 361 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CES3Q6UWW8 571 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 LRRC6Q86X45 466 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 HPS6Q86YV9 775 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MPP5Q8N3R9 675 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 DLG3Q92796 817 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 SYBUQ9NX95 663 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 MAST4O15021 2626 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.68□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 LRRK2Q5S007 2527 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 GOLGA8TH3BQL2 631 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 KPNA5O15131 536 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CEP104O60308 925 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 VAPBO95292 243 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 UMODP07911 640 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CCDC175P0C221 793 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 9.4
LTBP4-217ENST00000597151 FMO4P31512 558 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 BDKRB1P46663 353 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LTBP4-217ENST00000597151 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms