RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	PCM1	Q15154	2024 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TLCD2	A6NGC4	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CDC7	O00311	574 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	RFPL1	O75677	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL2	O95198	593 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	GFER	P55789	205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CLDN6	P56747	220 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CDKL1	Q00532	357 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	FOXC1	Q12948	553 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CSHL1	Q14406	222 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	MZB1	Q8WU39	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ATL1	Q8WXF7	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IL17F	Q96PD4	163 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	OARD1	Q9Y530	152 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900		E7ENX8	843 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SLC16A8	O95907	504 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IMPA1	P29218	277 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SHC2	P98077	582 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TAP2	Q03519	686 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	DLG1	Q12959	904 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ACAP2	Q15057	778 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PHKG1	Q16816	387 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ISCA2	Q86U28	154 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	LCA5	Q86VQ0	697 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KMT5C	Q86Y97	462 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IQCK	Q8N0W5	287 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	NXNL1	Q96CM4	212 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	NRTN	Q99748	197 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PPV9	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	GSAP	A4D1B5	854 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ISM1	B1AKI9	464 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	ANXA5	P08758	320 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	UGT2B7	P16662	529 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TFEB	P19484	476 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CCND1	P24385	295 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	MPST	P25325	297 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	HNMT	P50135	292 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	PPP1CA	P62136	330 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	IRF9	Q00978	393 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TGFBI	Q15582	683 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKN1-208	ENST00000586900	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.91	□□□□□ -0.5

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