RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574468.1

PAFAH1B1-208, Transcript of platelet activating factor acetylhydrolase 1b regulatory subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene PAFAH1B1, Length 1,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.4□□□□□ -1.22
PAFAH1B1-208ENST00000574468 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa7.4□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SPTA1P02549 2419 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 C5orf60A6NFR6 353 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 IQCF5A8MTL0 148 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 B4E171 279 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 BTN3A1O00481 513 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 VEGFDO43915 354 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 DNAJB5O75953 348 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 KIAA0754O94854 1291 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 VIPP01282 170 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PYGLP06737 847 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 MED14OSP0DP75 135 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CXCR5P32302 372 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TSPAN7P41732 249 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 KCNJ1P48048 391 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PRLHRP49683 370 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 NFATC3Q12968 1075 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CHAF1BQ13112 559 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 BIRC2Q13490 618 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 IL10RAQ13651 578 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 BRD3Q15059 726 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ZIC1Q15915 447 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 BCL7AQ4VC05 210 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ODF2Q5BJF6 829 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CCDC181Q5TID7 509 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 BROXQ5VW32 411 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 METRNLQ641Q3 311 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CPZQ66K79 652 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TTC27Q6P3X3 843 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CES3Q6UWW8 571 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 C12orf66Q96MD2 445 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 OR6C1Q96RD1 312 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 VAT1Q99536 393 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 HGH1Q9BTY7 390 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 DDA1Q9BW61 102 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TLR10Q9BXR5 811 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 COG4Q9H9E3 785 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 AMFRQ9UKV5 643 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PTPN13Q12923 2485 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SCN2AQ99250 2005 aa7.39□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 OR6C74A6NCV1 312 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 MROH6A6NGR9 719 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 STMND1H3BQB6 276 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ATE1O95260 518 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 AP2A1O95782 977 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 NTRK1P04629 796 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ST6GAL1P15907 406 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PSMA3P25788 255 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 NFKBIAP25963 317 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ACRV1P26436 265 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 STAT5AP42229 794 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 LMAN1P49257 510 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 RHDQ02161 417 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 FOXM1Q08050 763 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 GPS2Q13227 327 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PRKG2Q13237 762 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 AMZ2Q86W34 360 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.38□□□□□ -1.23
PAFAH1B1-208ENST00000574468 KRT222Q8N1A0 295 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms